Κολοκυθάκια με αυγά

Υλικά για 2 μερίδες    3 μεσαία προς μεγάλα κολοκυθάκια    1 μεγάλο κρεμμύδι    2 αυγά    1κ. σ. ελαιόλαδο    1 ντομάτα    Λίγο αλάτι    Πιπέρι    Θυμάρι