ΜΙΚΡΑ ΨΑΡΙΑ ΤΗΓΑΝΗΤΑ ΜΕ ΚΡΕΜΜΥΔΙ

½  κιλό μικρές μαρίδες (ή αθερίνες) 3 κόκκινα ξερά κρεμμύδια Ξύσμα από 1 λεμόνι Αλεύρι (για το πανάρισμα) 2 κλων. φρέσκο θυμάρι 5-6 κ.σ. εξαιρετικό παρθένο ελαιόλαδο Άλτις Απαλό Αλάτι-πιπέρι